Trajtimi i rrënjëve i referohet pastrimit të nervave të infektuara të cilat gjenden në kanalet e dhëmbit, dezinfektimit të tyre si dhe mbushjes së tyre me substanca adekuate për mbushjen e rrënjëve si pasoje e thyerjeve dhe çarjeve të formuara në dhëmbë, prishjeve në dhëmbë, proceseve të gabuara të trajtimit, dëmtimit të nervave dhe enëve të gjakut për shkak të restaurimeve të gabuara.